מצא בשכונת בית יעקב ברחוב אבישר 7 מול בור המים.
לפי שלט ההקדשה תרם את בית הכנסת יהודה לייב בן חיים לויטס שוחט ובודק מברמינגהם שבאנגליה שתרם בשנת 1877 10,000 גרוש ובשנת 1881 עוד 1,000 גרוש ולכן בית הכנסת נקרא על שמו – "בית יהודה".  בחצר בית הכנסת ישנם חדרים ששימשו בעבר את תלמוד תורה של ישיבת "עץ חיים".  בשנות ה – 40 פעלה בחדרים אלה ישיבת "תורת ירושלים" שהיתה כעין מכינה לישיבת "מרכז הרב".  את ספסלי העץ עשו בשנות ה – 30 האמנים דוד כהן ובנו מנדל.  בשנת 1937 עיצב מנדל את הרהיטים שבארמון המלך עבדללה בעמאן.  בשנות ה – 40 עיטר האומן יצחק ב"ק את קירות בית הכנסת בציוריו.
בגלל ריחוקה של השכונה מהעיר העתיקה היתה בבית הכנסת הזה דילמה מתי קוראים מגילה, האם ב – ט"ו באדר כמו בירושלים או ב – י"ד באדר כמו בכל הארץ.  לבסוף הוחלט לקרוא ב – י"ד בברכה וב – ט"ו ללא ברכה.  משך הזמן נבנו שכונות רבות ממערב לשכונה זו והיה ברור שהיא חלק מירושלים ולכן קראו רק ב – ט"ו ובברכה.
כיום פועלת בימי חול בבית הכנסת ישיבה ובשבת מתקיימות בו תפילות על ידי תושבים מהאזור.